@Selic_tre-mg acho que não tem jeito certo nem jeito errado. Aqui nós estamos fazendo como citei nesta outra postagem.
O importante é que o edital deixe claro quais são as regras e o pregoeiro alerte isso na sessão pública para que todas as empresas ofereçam propostas homogêneas, ou seja, respeitando as mesmas condições.