Valor estimado/referencial pregão X valor orçado fase interna

Prezados boa noite. Vi que já teve um tópico parecido com o que está acontecendo comigo, mas ainda tenho algumas dúvidas. Meu órgão realizou licitação para serviço de limpeza com critério menor preço global tendo itens com preço estimado. A empresa que ficou em primeiro lugar tem um preço global menor que o orçado pela Administração, porém tem alguns itens com valor muito acima do orçado. Estamos com receio de homologar e ter questionamentos futuros. negociamos com a empresa e ela abaixou alguns itens, mas outros não, justificando que o critério é apenas menor preço global e que não teria obrigatoriedade de baixar os preços. Sinceramente não achei acórdão do TCU sobre o tema nem respaldo jurídico para a decisão. Rogo ajuda de todos. Obrigado.