Prezado, acredito que esse não seja o caminho mais adequado. Perquirir os custos exatos da contratada não parece o mais inteligente, nem mesmo justo. Questões semelhantes foram discutidas no seguinte tópico:
https://gestgov.discourse.group/t/glosa-por-nao-fornecimento-de-vt/21344/21
Eu contribui com minhas opiniões lá. Aliás, mutatis mutandis, são as mesmas para o seu questionamento.
Abraço!