Caro @alecxpepe, qual seria o modelo de pagamento deste contrato? É Conta Vinculada ou Fato Gerador?
Se for Conta Vinculada, não cabe a perquirição de custos isolados na planilha de composição de custos. Se assim é feito, ao meu ver, esta conduta é inadequada. Se a empresa foi a vencedora com o menor valor quando do certame, então é evidente que a administração contratou com a proposta mais vantajosa, seja lá a forma com que a empresa estimou seus custos unitários. Aquilo que ela dimensionou a menor, é prejuízo que ela deverá suportar. O que foi dimensionado a maior é lucro. Não cabe essas perquirições de itens isolados.
Já foi muito discutido aqui no fórum acerca do fato de que a planilha de composição de custos em prestação de serviços com dedicação exclusiva de mão de obra não pode ser interpretada como “lista de compras”, pois fazer isso, desvirtua toda a lógica da terceirização, que é justamente o órgão se desincumbir dessas atividades de gestão e logística que são inerentes destes contratos e focar na sua atividade finalística.
Mas enfim, respeito sua posição.
Dê uma olhada neste tópico: Glosa por não fornecimento de VT - #22 de Alok
Discutimos muito sobre essas questões de perquirição de custos isolados. Se você for ficar perseguindo cada uma das rubricas da planilha que estão a maior ou a menor na execução, você vai é ficar louco, acredite.