Contratação em Lotes de Serviços e Materiais

Boa tarde a todos!
Em um processo licitatório do Governo Federal onde há formação de Lotes/Grupos contendo 02 (dois) itens, 01 (um) para aquisição de peças por maior desconto e 01 (um) para contratação de serviços de manutenção pelo menor valor.
Findado o processo o Licitante vencedor do Grupo, após tentativa de negociação do pregoeiro, se recusou a reduzir o valor ofertado no serviço para o menor lance ofertado no certame. Então, apesar de haver vencido o grupo, o licitante não ofertou o menor valor para o serviço.
No ato da contratação, por se tratar de Nota de Empenho, a Administração poderá fazer a contratação do Grupo usando 02 (dois) empenhos?
Agradeço a atenção de todos e aguardo as respostas

@Douglas1303!

Eu não entendi a relação entre o fato da empresa não ter ofertado o menor valor para o item e a sistemática de empenho para o grupo.

Em regra, um mesmo empenho pode conter diversos itens. Não há necessidade de se emitir mais de um empenho para o mesmo grupo de itens.