Aplicação de IMR - serviços com mais de um Nota fiscal

Prezados,

Estou escrevendo o Termo de referência de um serviço de terceirização integral de fornecimento de refeições com dedicação exclusiva de mão de obra e fiquei com uma dúvida sobre a forma correta de aplicação da glosa do IMR. Talvez vcs possam me ajudar.

A empresa emitirá uma nota fiscal referente aos postos de trabalho e outra nota fiscal referente às refeições fornecidas. Pensei em montar um IMR único, mas neste caso, como ficaria o desconto do valor da glosa? A contratada escolhe se ela irá retirar o valor da glosa apurado no valor total da fatura dos postos ou na das refeições? Ou devo montar IMR separados para cada serviço? Matematicamente muda bastante calcular a glosa sobre o valor total da nota ou pelos serviços separadamente.